この投稿のパート 1:最近、便のサンプルを uBiome に提出しました。詳しくはこちらをご覧ください。
最初の uBiome の結果が返ってきたら、uBiome ダッシュボードで [分類法をダウンロード] リンクを選択し、ポップアップするページをコンピュータのどこかに保存して、ファイルの末尾が .json であることを確認することをお勧めします。これにより、uBiome データがスプレッドシートに配置され、uBiome ダッシュボードだけにある場合よりも操作がはるかに簡単になります。
その後、Richard Sprague によるこのチュートリアル https://blog.richardsprague.com/2015/01/how-to-analyze-ubiome-sample-in-excel.html に従うと、データをさらに分析するのに役立ちます。
私は決して腸内微生物叢の専門家ではありません。まだわかっていないことがたくさんあり、uBiome テクノロジーを使用して腸内細菌をサンプリングできることは、まったく新しいことです。結果は 100% 正確ではなく、何が起こっているかの手がかりを提供するためだけに診断ツールとして使用することはできません。根底に到達したい特定の健康問題がある場合は、Geneva Diagnostics テストなど、実行できるはるかに包括的な便分析テストがあります. uBiome はもっと楽しいものです!
最初に注意すべき点は、ほとんどの腸内微生物種が 4 つの主要な門に属していることです。 とプロテオバクテリア 、およびグラム陽性の Firmicutes と放線菌 .したがって、これら 4 つの細菌門がサンプル結果の大部分を構成していることを期待してください。 Bacteroidetes と Firmicutes は、すべてのサンプルの大部分を占めます。これらは誰にとっても正常な腸内細菌です。
私の結果
- Bacteroidetes 58.61% – (このうち 53% は 1 つの属 – Prevotella です。私はブルキナファソの子供たちと一致します!)
- プロテオバクテリア 3.20%
- Firmicutes 35.27% – (これらの 95% は Clostridia です)
- 放線菌 0.35%
他との比較
注目ポイント:
<オール>
ファーミキューテスとバクテロイデスの比率 (F/B 比率)
有益な細菌の 2 つのグループ、バクテロイデスとファーミキューテスが人間の腸で優勢です。 2006 年に Nature に掲載された研究では、痩せた人に比べて肥満の人ではバクテロイデスの相対的割合が減少し (肥満の人はファーミキューテスが多く、バクテロイデスが少ない)、体重が減るとバクテロイデスの割合が増加することが示されました (他の研究では、同じこと）。 Bacteroidetes よりも Firmicutes の方が多い場合は、別のプロファイルを持つ人よりも減量や体重維持が難しいと感じるかもしれません.
私はいつもスリムで、体重に問題はありませんでした (私の体重は 8 から 8 1/2 ストーン (112-119 ポンド) の間です) ので、私の比率が予想されるものと一致するのを見るのは興味深いと思いました。ただし、私の比率は他のグループとはまったく異なります.これが何らかの意味で重要であるかどうかはわかりません.また、比率と肥満の間に相関関係がないことを発見した研究もあります.
3 種類の腸の生態系の 1 つ
腸のエンテロタイプの存在は、まだ議論の余地があります。ただし、ウィキペディアから抜粋した次の説明は次のとおりです。
「エンテロタイプ 腸内微生物叢における細菌学的生態系に基づく生物の分類です。 3 つのヒト エンテロタイプの発見は、2011 年 4 月号の Nature で Peer Bork とその仲間によって発表されました。彼らは、エンテロタイプが年齢、性別、体重、または国の部門によって決定されないことを発見しました.長期的な食事がエンテロタイプに影響を与えるという兆候があります.
- タイプ 1 は高レベルのバクテロイデスが特徴です
- タイプ 2 にはバクテロイデスはほとんどありませんが、プレボテラは一般的です
- タイプ 3 はルミノコッカスのレベルが高い
ブルキナファソ (アフリカ) の子供たちの腸内細菌の研究では、Prevotella は腸内細菌の 53% を占めていましたが、同じ年齢のヨーロッパの子供たちには存在しませんでした.
研究によると、長期的な食事は腸内微生物叢の構成と強く関連していることも示されています。西洋の食事に典型的なタンパク質と動物性脂肪をたくさん食べる人は主にバクテロイデス菌を持っていますが、炭水化物、特に繊維をより多く消費する人では Prevotella 種が優勢です。 .」
私の腸内で何が優勢になるかを予測しなければならないとしたら、私はバクテロイデスと言ったでしょう. なぜなら、私は人生のほとんどで典型的な西洋の食事を食べており、常に肉、魚、卵、動物性脂肪をたくさん食べてきたからです.過去2年間、私はこれらすべての食品が豊富な、主に古風な食事を食べてきました.パレオを発見する前のかなりの数年間、私はアトキンスダイエットに沿って低炭水化物ダイエットを食べました.したがって、uBiome によると、「菜食主義者、非西洋人、および炭水化物が豊富でタンパク質と動物性脂肪が少ない食事をしている人々の腸内」でより一般的である、Prevotella によって私の腸が支配されているのは奇妙だと思います。私は植物性食品と肉をたくさん食べており、おそらく毎日 8 ～ 10 食分の果物と野菜を食べているので、プレボテラが優勢な理由が少し説明できるかもしれません.
多様性
微生物叢の可能性のあるメンバーのプール全体は大きい (1000 種を超える) 一方で、150 から 170 種というはるかに少ない数が、特定の個人で優勢であることがわかっています。一般に、科学文献では、生物の多様性が高いことは比較的健康な状態と関連付けられており、多様性が低いことは病気や慢性的な機能不全の状態と関連付けられています。 MG-Rast を使用し、Tim Steele の寛大な支援を受けて（すばらしい情報源である彼のブログをチェックしてください）、このサンプルの多様性スコアを 14.67 と計算しました。 .ティムによると、「一般的に、食物繊維、特に難消化性でんぷんをたくさん食べる人にとって、多様性は 30 ～ 50 の範囲になります。多様性の低下は、一般に、腸内細菌叢と食物繊維の少ない食事に関連しています。」 （しかし、現時点では私はこれについて心配していません - 妊娠に関する以下のメモを参照してください）. MG-Rast を使用して自分の uBiome の結果を分析したい場合は、Tim が彼のブログでチュートリアルを作成しています。
妊娠中のマイクロバイオームの変化
このサンプルを採取したとき、私は妊娠約 24 週でした。この研究では、妊娠第 1 期と第 3 期の妊婦の腸内微生物叢に注目し、いくつかの興味深い発見がありました。
「腸内微生物叢は、妊娠初期 (T1) から妊娠後期 (T3) に劇的に変化し、母親間の多様性が大幅に拡大し、プロテオバクテリアとアクチノバクテリアが全体的に増加し、豊かさが減少しました。」
「妊娠中の腸内細菌叢の劇的なリモデリングについて説明します。妊娠初期の腸内微生物叢は互いに類似しており、正常な健康な対照の腸内微生物叢に匹敵しますが、妊娠の過程で系統発生の組成と構造が大幅に変化します。妊娠第 3 期までに、被験者内の多様性が減少したにもかかわらず、被験者間の多様性が大幅に拡大し、T3 サンプルの大部分でプロテオバクテリアとアクチノバクテリアの濃縮が観察されました。さらに、健康関連のバクテリアの存在量も影響を受けます。たとえば、 フェカリバクテリウム は、炎症性腸疾患で枯渇する抗炎症効果を持つ酪酸産生物質であり (Sokol et al., 2008)、T3 では平均してあまり豊富ではありません。妊娠第 3 期までに、各女性の微生物叢は、T1 組成からは予測できない方法で分岐し、健康状態や食事記録とは関連付けられていませんでした。それにもかかわらず、大多数の女性では、T1 から T3 への移行にはプロテオバクテリアの存在量の増加が含まれており、これは炎症関連の異常症で繰り返し観察されています (Mukhopadhya et al., 2012)。」
「要約すると、妊娠は腸内微生物叢の深刻な変化と関連していることが示されました。妊娠初期の腸内微生物叢は、多くの面で健康な妊娠していない男性と女性の対照と似ていますが、妊娠後期までに、コミュニティの構造と構成は、女性間で異なる疾患関連の腸内細菌叢に似ています。微生物叢の変化をもたらす根本的なメカニズムはまだ解明されていませんが、ホルモンの変化も重要かもしれませんが、特に粘膜表面での免疫系の変化が微生物叢の変化を引き起こすと推測しています.
代謝異常、炎症、および体重増加はメタボリック シンドロームの特徴であり、妊娠していない個人の 2 型糖尿病のリスクを高めます。これらと同じ変化は、正常な妊娠の中心であり、脂肪組織へのエネルギー貯蔵を促進し、胎児の成長を促進するため、非常に有益である可能性があります。」
これは、このサンプルの結果、特に多様性スコアやプロテオバクテリアのレベルをあまり読み取れないことを意味します.赤ちゃんが生まれてから数週間後に別のサンプルを採取する予定です.
行方不明の微生物 – 重要性は?
- Verrucomicrobia 門が完全に欠落しているため、Akkermansia 属が不明です .この属には、単一のグラム陰性種 (Akkermansia muciniphilia) が含まれています。最近実施された研究では、腸管内のアッカーマンシア・ムシニフィラが肥満、糖尿病、炎症を媒介する可能性があり、重要な細菌であることが示されています。
- 全体的に放線菌が少なく、ビフィズス菌 は検出されません .ビフィズス菌は非常に有益であると考えられていますが、最近 Gut Guardians Podcast でティム・スペクターの話を聞いて、ビフィズス菌の存在は西洋人では健康の兆候と見なされていますが、多くの非西洋人にはビフィズス菌がなく、これは
- 低クリステンセネラ科が検出され、クリステンセネラは検出されませんでした
- 低い乳酸菌
- Grace Liu が提案した「祖先コア」の他のメンバー (種レベル) は、私のサンプルでは検出されませんでしたが、Roseburia intestinalis、Eubacteria rectale、Bacteroides vulgatus、Alistipes putredinis です。 .存在していた種は Faecallibacterium prausnitzii です と ルミノコッカス ブロミ . ローズブリア 属レベルで検出されました。
私はこれらの専門家ではないので、これらの欠落しているバクテリアの重要性、または妊娠後に別のサンプルを採取した場合、状況が異なるかどうかについては、実際にはまったくわかりません.私は 2015 年 9 月 24 日に Grace Liu (www.thegutinstitute.com) と Chris Kelly (www.nourishbalancethrive.com) とのウェビナーに参加しているので、その後でさらに洞察が得られるかもしれません!
サンプル中の病原体
レベルが高い場合、uBiome サンプル中の病原体の存在は懸念の原因となる可能性があります。一般的に、病原体のない腸は良いことです.私のサンプルには、病原性のある 2 つの種が含まれていました:
- Prevotella copri – 2.4%
- クロノバクター サカザキイ 2.35%
これらのレベルが高いと見なされるのか、それとも懸念の原因になるのか、私にはわかりません.私のサンプルには、大腸菌、サルモネラ菌、赤痢菌、ピロリ菌など、よく知られている病原菌は見られませんでした。問題を引き起こさない病原性細菌が腸内に存在する可能性があり、これらの病原体が増殖して問題を引き起こす可能性があるのは、一連の抗生物質などの後でのみである可能性があります.
腸内細菌叢のプロファイルを改善するために何ができますか?
有益な共生細菌を促進および維持するには、プロバイオティクス (生きた細菌) を追加して、食事中の繊維の量を増やしたり、プレバイオティクス サプリメント (土着の微生物叢をサポートする製品) を検討したりしてください。
プロバイオティクス
- 乳酸菌
- ビフィズス菌
- 土壌生物
私は、現在市場で入手可能な最高のプロバイオティクスの 1 つ (および英国で製造されているもの) は、9 種類の乳酸菌とビフィズス菌の非常に高い強度を含む Elixa-Probiotic だと考えています. Tommy Wood と私は最近、Elixa の創設者である Karl Seddon と共に Eat Better Podcast のエピソードを録音しました。ここで聞くことができます。
食物繊維の量を増やす
プレバイオティクス
- オオバコ
- ベータグルカン（オートブラン）
- フラクトオリゴ糖（ヤーコン）
- ガラクトオリゴ糖（ビミューノ）
- イヌリン（チコリの根の粉末）
- アラビノガラクタン
- アカシア（ヘザーのおなかの繊維）
植物
植物製品（ベルベリン、ニームなど）は、腸内細菌を減少または調節するためにも使用できます.詳細については、Grace Liu のブログをご覧ください。
My High-Fibre Paleo Experiment について読んで、その後のサンプル を uBiome に送信した後、最新情報をお待ちください。
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