トマト ゲノミクス コンソーシアムは、トマト Solanum Lycopersicum のゲノムを完全に配列決定しました .彼らは、Journal Nature で、トマトは 12 の染色体上に配置された約 35,000 の遺伝子を持っていると報告しています。この研究は、多肉果の進化に関する洞察を提供し、植物育種家が特定の望ましい特性を備えた新しい品種をより迅速に生産できるようにします。
初めて、トマト Solanum lycopersicum のゲノム が解読されました。これは、トマトや他の作物の収量、栄養、耐病性、味、色を改善するための重要なステップです。
完全なゲノム配列と、近縁の野生種 (Solanum pimpinellifolium) の配列 )、ジャーナル Nature の 5 月 31 日号に掲載されています .具体的には、ゲノムは「Heinz 1706」トマトから配列決定されました。
この出版物は、アルゼンチン、ベルギー、中国、フランス、ドイツ、インド、イスラエル、イタリア、日本、オランダ、韓国、スペイン、英国、および米国を含む国際協力であるトマト ゲノミクス コンソーシアムのメンバーによる長年の研究をまとめたものです。
コンソーシアムの研究者は、トマトが 12 の染色体上に配置された約 35,000 の遺伝子を持っていると報告しています。ボイス・トンプソン植物研究所 (BTI) の科学者である James Giovannoni は、次のように述べています。コーネル キャンパス) と米国農務省 (USDA) が米国トマト配列決定チームを率いており、このチームには 9 つの大学、USDA、野生のトマトのゲノム配列が開発されたコールド スプリング ハーバー研究所の研究者が含まれています。
これらの遺伝子の配列と染色体上のそれらの配置は、Nature の記事に記載されています。 「トマトのゲノム配列は、肉質の果物の進化に関する洞察を提供します」と研究者は記事で述べています。また、植物育種家は、特定の望ましい特性を持つ新しい品種をより迅速に生産することもできます。
「トマトの遺伝学は、すべての家庭菜園家が知っていて、すべてのスーパーマーケットの買い物客が望んでいる味の改善の可能性の根底にあり、ゲノム配列は、トマトの生産と品質におけるこれと他の多くの問題を解決するのに役立ちます」とGiovannoni氏は述べた.
ある品種のトマトのゲノム配列が明らかになったので、種子会社や植物育種家が研究開発のために他の品種の配列を決定することはより簡単になり、はるかに安価になるだろう、と彼は付け加えた.最初のトマトのゲノム配列には数百万ドルの費用がかかりましたが、これらの最初の発見に基づいて構築することにより、その後の費用は 10,000 ドル以下になる可能性があります。
BTI では、科学者の Lukas Mueller と彼のチームがインタラクティブな Web サイトを作成して、トマトと関連種の遺伝子配列へのアクセスを提供し、Zhangjun Fei と Joyce Van Eck が配列とその分析作業に貢献しました。
イチゴ、リンゴ、メロン、バナナ、および他の多くの肉質の果物は、トマトといくつかの特徴を共有しているため、果物の成熟に関与する遺伝子と経路に関する情報をトマトに適用できる可能性があると、Giovannoni 氏は述べています。コストを削減します。
「これで、果物の生物学、耐病性、根の発達、栄養価について、さらに興味深い質問をすることができるようになりました」とジョバンノニは言いました.トマトは、米国だけで 20 億ドルの市場を占めています。 USDA は、アメリカ人が年間平均 72 ポンド以上のトマト製品を消費していると推定しています。
シーケンスは、1990 年代のコーネル大学のスティーブン タンクスリーと BTI のグレッグ マーティンの重要な研究に基づいています。 Tanksley、Martin、およびその他の Ithaca の科学者は、トマトの遺伝子地図やその他の分子ツールを開発して、耐病性のメカニズムを研究しました。これらのツールは、最終的にコンソーシアムのシーケンス作業への道を開いた、と Giovannoni 氏は述べています。
参照:
The Tomato Genome Consortium、2012 年 5 月 30 日、Nature .
DOI:10.1038/nature11119
「あなたはトマトと言う」2012 年 5 月 30 日、Nature .
DOI:10.1038/485547a
米国でのトマトのゲノムと配列決定の研究は、全米科学財団と USDA の支援を受けました。
